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流谓流类，等谓相似，已显类同。所言流者，是流住义，果从因起，因所流故，名之为流。所言等者，谓相似义，或所生果，与因相似，名之为等。［19］
(2)我执习气者：谓六七二识虚妄执为我我所，所熏种子。我执有二种：(一)俱生我执；(二)分别我执。由此二我执所熏种子，令有情等自他差别，所以分别而立我执习气名。我见熏飞，体即名言，由起我执，执有自他，名我见习，寻名言而熏种子，与等流种子无差别，但据三熏习别离而体无别也。
(3)有支习气者：即业种子，亦名异熟习气，谓由第六意识发起善不善业所熏种子。有者，谓三有；支者，因义、分义。有支者，即有二义：一者有漏善，谓即能招人天可爱果的业种子。二者不善，即能招三恶趣非可爱果的业种子。由此，二支所熏种子，令异熟果善恶趣差别，即能招异熟果之增上缘也。言异熟者，即由善恶因所引生总别二报无记果。此与异熟果为因，故名异熟习气。
摄大乘论世亲释云：名言熏习差别者，谓眼名言熏习，在异熟识中为眼生因，异熟生眼。从彼生时，用彼为因，还说为眼。如是耳等一切名言差别，亦尔。我见熏习差别者，由染污意萨迦耶见力故，于阿赖耶识中我执熏习生。由此为因，谓自为我异我为他，各有差别。有支习气差别者，由善不善不动行力故，于诸趣中流转差别。已上三种熏习，其差别如是，然而非离等流习气别有我执、有支二种习气，但依其义而立名。
无漏色心种子者：即能得三乘道者，基本识内，无始以来，法尔有能生无漏法之功能。此亦有三：一生空无漏种子，能生三乘道无漏法之种子也。二法空无漏种子；三俱空无漏种子，能生菩萨及佛果无漏法之种子。此无漏种子，无始以来，附在第八阿赖耶识之中，前灭后生，展转传来。
五、种子与现行之因果
关于种子与现行之因果关系，分为二种：一、异时因果；二、同时因果。
(一)异时因果者：即一切种子，由无始以来，含藏于第八阿赖耶识中，前刹那种子，生后刹那种子，前灭后生，自类相续，犹如川流，昼夜不息，是为种子生种子。又种子生种子，前刹那种子为因，后刹那种子为果，是因先果后。
(二)同时因果者：即含藏于第八阿赖耶识中的每一种子，缘不具时，只是前灭后生，自类相续；若遇众缘和合时，则能生起各自现行，是名种子生现行。其所生起的现行中，有强盛势用者，于生起之刹那，再熏习各自种子于第八识自体中，成为新熏种子，是名现行熏种子。在一刹那中，本有种子生起现行，现行又熏成新种子；本有种、现行及新熏种三法；及种子生现行，现行熏种子，展转相依，构成二重因果。譬如明灯，焰炷生烧，同时更互；又如芦束，互相依持，同时不倒。是谓三法展转，因果同时，若种子望种子而论，前念种子生后念种子，前念后念相续故，因果异时。而就第八识而论，第八阿赖耶只所持种子为因，生眼等七转识。同时七转识现行法为因，生第八阿赖耶识种子。因此说，七转识与第八阿赖耶识而成互为因果关系，这是在于能生所生，能熏所熏方面而讲。所熏的，能生的，是第八识中能生果法作用的种子即“种子生现行的因果”，第八识为因，七转识为是果，赖耶能藏之义，正是于此。所生的，能熏的，是七转识诸法即“现行熏种子的因果”，七转识为因，第八识是果，赖耶所藏之义，正是于此。《阿毗达摩经》云：
“诸法于识藏，识于法亦尔，更互为果性，亦常为因性。”［20］
这颂中的意义，也正是说明了互为因果的关系。其次，所生的现行虽同时熏习生起种子，然而所熏种子于同时不生起现行，以其趣种子众缘未具故。倘是所熏的种子同时生起现行，那现行又熏其种子，如此又熏又生，没有穷尽了；又于同一心时，有二心或多心生的过失；所以必须待他时缘具击发此种，才得生起。这所熏的种子在未遇缘现行生起以前，都是第八识中前生后灭，前生后灭，自类相继的生灭，这名为“种子生种子的因果”。前念种子是因，后念种子是果，亦名为“异时因果”。
以上所说的种子生现行，现行熏种子，种子生种子，有情自无始以来，展转相续不断的在生灭着。就是从第八识中的种子所生的七转识现行诸法；而又熏习种子于第八识中相续生灭；遇缘具足又生现行。故中间虽经过百千万亿的变化，而始终没有超越过这个历程。故知染净缘起的根本，就是第八阿赖耶识。
六、种子与赖耶及所生果之关系
种子与第八阿赖耶识以及所生起的现行果法等，究竟是一体的?或是异体的?为什么要提出这个问题?因为所谓种子，决不是离第八识而独立存在的。既然如此，种子与第八阿赖耶识的关系究竟如何?当然是值得论究的问题。在《摄大乘论》中唯就以体、用门来说明种子与第八识的关系。如《摄大乘论》云：
阿赖耶识中诸杂染品法种子，为别异住?为无别异?非彼种子有别实体于此中住，亦非不异。然阿赖耶识如是而生。有能生彼功能差别，名一切种子识。［21］
如此种子是第八阿赖耶识自体上之作用，而阿赖耶识是此用所依之体。体用有别，故非一。虽然，用者所依体上之用，体者用所依之体；是故体用不相离，故又非异。无性释论云，一切种子，是阿赖耶识功能差别，如法作用，与诸法体非一非异。虽然若体论别，则种子者，色心三性诸法所熏生，又现生三性诸法。从现行果，因种了亦通于三性，故与本识非一。其次，就因果门来论，种子与所生果的关系。即种子与其所生现行果法，亦有非一非异的关系。因为，现行(果)是种子(因)的显现相状，是用；种子是现行果的本质，是体。既是一体一用，故亦非一非异。又种子者，即三性诸法能生因，而诸法者所生果也。因果相顺，故非异。虽然，种子隐伏于第八识中之能生作用。诸法者，用已显明之现行。隐显有别，故非一。如《瑜伽师地论》卷五十二云：
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